MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187094	GAA	2	6	14	19	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187094	GACG	2	8	29	36	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NT_187094	T	6	6	40	45	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187094	AGCGC	2	10	81	90	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NT_187094	CCG	2	6	107	112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NT_187094	GGC	2	6	116	121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187094	ACCC	2	8	194	201	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NT_187094	TA	3	6	236	241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187094	CAAA	2	8	722	729	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NT_187094	TTTA	2	8	740	747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187094	CAA	2	6	802	807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NT_187094	TCT	2	6	3851	3856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187094	GAC	2	6	3888	3893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187094	AAT	2	6	3904	3909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187094	CG	3	6	7877	7882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NT_187094	GAG	2	6	7911	7916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187094	ACA	2	6	7927	7932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NT_187094	TGG	2	6	8030	8035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187094	CG	3	6	9104	9109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NT_187094	ATG	2	6	9118	9123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187094	CTT	2	6	9927	9932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_187094	AATT	2	8	10040	10047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187094	TCA	2	6	10052	10057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NT_187094	TA	4	8	10117	10124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187094	CAA	2	6	10133	10138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_187094	CCGA	2	8	10166	10173	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NT_187094	AAT	2	6	10179	10184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187094	TAA	2	6	10600	10605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187094	A	7	7	11285	11291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187094	T	6	6	11298	11303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187094	TGG	2	6	11332	11337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187094	TG	3	6	13602	13607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187094	T	7	7	13699	13705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187094	GTT	2	6	13711	13716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187094	TTA	2	6	16155	16160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187094	ATAAA	2	10	16164	16173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187094	GA	3	6	16182	16187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187094	A	6	6	16196	16201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187094	ACG	2	6	16272	16277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NT_187094	GTT	2	6	16305	16310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187094	ACA	2	6	16350	16355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_187094	ACAA	2	8	16358	16365	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NT_187094	TTGC	2	8	16413	16420	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NT_187094	TTTGG	2	10	16465	16474	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187094	GTT	2	6	19214	19219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187094	A	6	6	19265	19270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187094	TGTAG	2	10	19330	19339	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187094	GCG	2	6	19343	19348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NT_187094	ATA	2	6	19416	19421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187094	GAA	2	6	19434	19439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187094	CAT	2	6	19583	19588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187094	CCA	2	6	19607	19612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NT_187094	ATG	2	6	19628	19633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187094	CCT	2	6	21454	21459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NT_187094	AT	3	6	25589	25594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187094	GTT	2	6	25598	25603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187094	TTTCA	2	10	26011	26020	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NT_187094	ACT	2	6	26030	26035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NT_187094	CAG	2	6	26216	26221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NT_187094	GGC	2	6	26230	26235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187094	CTG	2	6	26569	26574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_187094	GGC	2	6	26617	26622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NT_187094	TGA	2	6	26644	26649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187094	TGC	2	6	26655	26660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187094	TAT	2	6	26676	26681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187094	TGA	2	6	26711	26716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187094	A	7	7	26769	26775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187094	TAG	2	6	26793	26798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187094	T	6	6	27256	27261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187094	AAT	2	6	27281	27286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187094	AAT	2	6	27309	27314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187094	GACC	2	8	27337	27344	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NT_187094	GT	3	6	27379	27384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187094	ACCCAA	2	12	27533	27544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NT_187094	CCAAG	2	10	27556	27565	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NT_187094	TGG	2	6	27978	27983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187094	A	6	6	31691	31696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187094	AAT	2	6	31746	31751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187094	GAA	2	6	31758	31763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187094	AGC	2	6	31809	31814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187094	GGC	2	6	31831	31836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NT_187094	GCG	2	6	31888	31893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NT_187094	CG	3	6	31892	31897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NT_187094	CAA	2	6	31977	31982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187094	GCG	2	6	32029	32034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187094	ACA	2	6	32062	32067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NT_187094	TTCT	2	8	32107	32114	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NT_187094	TA	3	6	32132	32137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187094	AGT	2	6	32139	32144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187094	G	6	6	32447	32452	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187094	AGA	2	6	32462	32467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187094	GTT	2	6	32497	32502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187094	GTA	2	6	32530	32535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187094	TCG	2	6	32564	32569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NT_187094	TGA	2	6	32603	32608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187094	ATT	2	6	32627	32632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187094	AGGC	2	8	32650	32657	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NT_187094	AAC	2	6	32702	32707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NT_187094	CTG	2	6	32714	32719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NT_187094	CAT	3	9	33362	33370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NT_187094	TTC	2	6	34246	34251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NT_187094	AAT	2	6	35093	35098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187094	TTA	2	6	35150	35155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187094	CCTCG	2	10	35183	35192	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
105	NT_187094	GTTTTT	2	12	35198	35209	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187094	T	8	8	35205	35212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187094	GGT	2	6	35213	35218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187094	G	7	7	35243	35249	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187094	GTC	2	6	35295	35300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NT_187094	GAG	2	6	35323	35328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187094	AG	3	6	35351	35356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187094	TCT	2	6	35393	35398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NT_187094	AAG	2	6	35438	35443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187094	CGG	2	6	35521	35526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NT_187094	CTTTTT	2	12	35528	35539	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NT_187094	CAT	2	6	35551	35556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NT_187094	TCA	2	6	35604	35609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NT_187094	CA	3	6	35608	35613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NT_187094	A	6	6	35719	35724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187094	T	6	6	35835	35840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187094	GCC	2	6	35863	35868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NT_187094	CCTA	2	8	36362	36369	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NT_187094	TCT	2	6	36372	36377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NT_187094	TAT	2	6	36416	36421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187094	TTC	2	6	36425	36430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NT_187094	TTAA	2	8	36451	36458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187094	TAT	2	6	36464	36469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187094	AATA	2	8	36490	36497	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187094	TCC	2	6	36498	36503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NT_187094	GGA	2	6	36513	36518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187094	TATT	2	8	36519	36526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187094	CA	3	6	36552	36557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NT_187094	CTG	2	6	36639	36644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NT_187094	TGT	2	6	36678	36683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187094	T	6	6	36703	36708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187094	TTA	2	6	37423	37428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187094	CAAT	2	8	37487	37494	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NT_187094	CAACC	2	10	37616	37625	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
139	NT_187094	TCAC	2	8	37629	37636	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NT_187094	ATC	2	6	37654	37659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NT_187094	T	6	6	39017	39022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187094	T	7	7	45571	45577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NT_187094	T	7	7	47968	47974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NT_187094	CGG	2	6	48427	48432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NT_187094	TCA	2	6	48717	48722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NT_187094	GCC	2	6	48749	48754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NT_187094	TGG	2	6	48789	48794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NT_187094	CAG	2	6	48796	48801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NT_187094	GGC	2	6	48856	48861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NT_187094	CA	3	6	48913	48918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NT_187094	CGAT	2	8	52123	52130	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NT_187094	CTG	3	9	52153	52161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NT_187094	AAT	2	6	52183	52188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NT_187094	A	7	7	52190	52196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NT_187094	T	6	6	52774	52779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NT_187094	T	6	6	53365	53370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NT_187094	TAA	2	6	53391	53396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NT_187094	ATAA	2	8	53418	53425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NT_187094	TC	3	6	53433	53438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NT_187094	ACA	2	6	55496	55501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NT_187094	CGG	2	6	55528	55533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NT_187094	TTAT	2	8	55539	55546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NT_187094	TGAA	2	8	59195	59202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
164	NT_187094	GCCT	2	8	59209	59216	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
165	NT_187094	GCGG	2	8	59217	59224	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
166	NT_187094	T	6	6	59227	59232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NT_187094	ACA	2	6	63312	63317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NT_187094	AATA	2	8	63386	63393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NT_187094	AG	3	6	63437	63442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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171	NT_187094	TGT	2	6	63521	63526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NT_187094	GAAA	2	8	63575	63582	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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174	NT_187094	AGA	2	6	63641	63646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NT_187094	GAA	2	6	64296	64301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NT_187094	ATA	2	6	64346	64351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NT_187094	TGA	2	6	64381	64386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178	NT_187094	TG	3	6	64415	64420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
179	NT_187094	CTAA	2	8	64428	64435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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181	NT_187094	CAGC	2	8	64452	64459	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
182	NT_187094	TAT	2	6	64468	64473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NT_187094	TTAT	2	8	64494	64501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NT_187094	GAA	2	6	64511	64516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
185	NT_187094	CTGT	2	8	64520	64527	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
186	NT_187094	GCA	2	6	64615	64620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
187	NT_187094	ACC	2	6	64634	64639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
188	NT_187094	T	6	6	64658	64663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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190	NT_187094	T	6	6	64668	64673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.